与其他被毛动物的清洁方式一样，仓鼠也可以进行水洗，但是必须严格控制水的温度，一般37至40度为宜。在清洗时应当轻柔且不可用力揉搓，带清洗过后应用毛巾等，进行全身的擦拭，以确保在清洗后，被毛不会潮湿，从而造成体温的丧失。应使用低功率的吹风机或者烘干箱进行烘干，避免全身的潮湿和刺耳声音的惊吓。