虹膜色谱是猫科动物的遗传身份证，其呈色机制如同精密的光学实验。基底层的基质细胞含有黑色素体，数量与分布决定最终色调：铜色眼源于密集的圆形黑色素颗粒，绿色眼因梭形颗粒形成廷德尔效应，蓝色则是完全缺乏黑色素的瑞利散射结果。幼猫的"胎蓝眼"会在6-12周逐渐消退，但重点色基因携带者终生保持蓝眸。罕见的异色瞳常与白斑基因相关，其形成机制是胚胎期黑色素细胞迁移受阻。虹膜颜色变化可能预示疾病，中年猫出现虹膜色素沉着斑需排查葡萄膜炎，突然变浑浊可能是高血压导致的前房出血。特定品种的瞳色标准严苛，例如暹罗猫的宝石蓝必须符合Pantone 2925C色卡，布偶猫的蓝眼则需达到D65光源下的特定明度值。