狗狗肛温39摄氏度不算发烧。正常情况下狗狗的肛温在37.5-39.2摄氏度都是正常的，主人不用过于担心。但如果狗狗的肛温在39.2-40度之间，则表明狗狗处于低烧状态，建议主人使用酒精擦拭狗狗脚垫及耳朵处，并给狗狗饮水进行物理降温。如果狗狗肛温超过40度则为高烧，需要立即注射退烧针进行治疗。