犬细小病毒病程呈现典型阶段性特征，感染后3-7日为危险期。发病初期（第1-2天）主要表现为嗜睡、厌食及低热（39.5-40℃），粪便尚未带血但隐血试验呈阳性。极期（第3-5天）出现特征性番茄汁样血便，白细胞计数骤降至＜2000/μL，肠道上皮大面积坏死导致蛋白质丢失，血浆总蛋白＜4g/dL提示预后不良。此阶段易并发败血症、肠套叠或DIC，死亡率高达80%。

存活转折点通常出现在第5-7日，若白细胞开始回升（＞5000/μL），便血频率减少，则表明免疫系统逐渐控制病毒复制。静脉营养支持至关重要，需维持葡萄糖＞60mg/dL、钾离子＞3.5mEq/L，单克隆抗体（1ml/kg）早期应用可中和游离病毒。环境消毒需选用次氯酸钠（1:32稀释），患病犬排泄物中病毒可在室温下存活5个月。康复期应喂食低脂易消化处方粮，3个月内避免与其他犬接触，痊愈犬可获得持久免疫力但可能成为隐性带毒者。