兔眼颜色由虹膜色素和血管反射共同决定，存在丰富变异。白化病兔因缺乏黑色素呈现典型红眼，这是眼底血管的反光效果。普通家兔常见棕色虹膜，深浅从琥珀色到黑褐色不等。少数品种拥有蓝色虹膜，如维也纳兔的蓝眼睛由特殊的瑞利散射效应形成。更罕见的是异色瞳现象，可能一侧蓝眼一侧棕眼，这种情况通常伴随听力缺陷。红眼警示信号是突然出现的充血现象，可能由角膜溃疡或青光眼引起。健康兔子的眼白部分应几乎不可见，过多显露可能是眼球内陷的征兆。泪腺分泌异常会导致眼角毛发染色，白色兔子会显现红色泪痕，而深色兔则呈现铁锈色。日常护理要注意避免垫料粉尘入眼，清洁时使用专用洗眼液而非清水。老年兔（6岁以上）可能出现晶状体混浊，但不同于白内障的完全白膜，正常老化会呈现轻微的蓝灰色调。特殊品种如垂耳兔要定期检查眼睑是否内翻，睫毛可能持续摩擦角膜造成损伤。